O grande diferencial do Curso de Bacharelado em Sistemas de Informação da Toledo Presidente Prudente é a estrutura da sua matriz curricular, baseada em três núcleos de formação(Básica, Tecnológica e Complementar) e nove eixos temáticos ( Sistemas de Informação, Matemática, Lógica Computacional, Web e Banco de Dados, Infra-estrutura de Tecnologia,  Desenvolvimento de Sistemas, Modelagem de Sistemas, Visão Empresarial e Práticas Supervisonadas).